Procedura PHREG
Analiza bayesowska
| Informacje o modelach | |
|---|---|
| Zbiór | WORK.METABRIC_CLEANED |
| Zmienna zależna | t |
| Zmienna cenzurująca | c |
| Wartości cenzurujące | 0 |
| Model | Cox |
| Rangi wiązane | BRESLOW |
| Algorytm próbkowania | ARMS |
| Wielkość wyżarzania | 5000 |
| Wielkość próbki MC | 50000 |
| Przerzedzanie | 5 |
|
Liczba obserwacji wczytanych
Liczba obserwacji użytych
|
854
854
|
|---|
| Informacje o poziomach klasyfikacji | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Klasa | Wartość | Zmienne projektowe | ||||
| lnep_c | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | |
| 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | ||
| 2 | 0 | 0 | 1 | 0 | ||
| 3 | 0 | 0 | 0 | 1 | ||
| 4 | 0 | 0 | 0 | 0 | ||
| age_c | 1 | 1 | 0 | 0 | ||
| 2 | 0 | 1 | 0 | |||
| 3 | 0 | 0 | 1 | |||
| 4 | 0 | 0 | 0 | |||
| radio_therapy | 0 | 1 | ||||
| 1 | 0 | |||||
| ts_c | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 |
| 2 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | |
| 3 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | |
| 4 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | |
| 5 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | |
| 6 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |
| her_status | 0 | 1 | ||||
| 1 | 0 | |||||
| Podsumowanie liczby zdarzeń i wartości ocenzurowanych | |||
|---|---|---|---|
| Suma | Wystąpienie | Ocenzurowane | Procent ocenzurowanych |
| 854 | 370 | 484 | 56.67 |
| Informacje o parametrach regresji | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | Efekt | lnep_c | age_c | radio_therapy | ts_c | her_status |
| lnep_c0 | lnep_c | 0 | ||||
| lnep_c1 | lnep_c | 1 | ||||
| lnep_c2 | lnep_c | 2 | ||||
| lnep_c3 | lnep_c | 3 | ||||
| age_c1 | age_c | 1 | ||||
| age_c2 | age_c | 2 | ||||
| age_c3 | age_c | 3 | ||||
| radio_therapy0 | radio_therapy | 0 | ||||
| ts_c1 | ts_c | 1 | ||||
| ts_c2 | ts_c | 2 | ||||
| ts_c3 | ts_c | 3 | ||||
| ts_c4 | ts_c | 4 | ||||
| ts_c5 | ts_c | 5 | ||||
| her_status0 | her_status | 0 | ||||
| Oceny największej wiarygodności | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | DF | Ocena | Błąd standardowy |
Przedział ufności 95% | |
| lnep_c0 | 1 | -1.0287 | 0.3045 | -1.6255 | -0.4318 |
| lnep_c1 | 1 | -0.7467 | 0.3035 | -1.3416 | -0.1518 |
| lnep_c2 | 1 | -0.2893 | 0.3072 | -0.8913 | 0.3128 |
| lnep_c3 | 1 | 0.1706 | 0.3147 | -0.4463 | 0.7875 |
| age_c1 | 1 | -0.7491 | 0.1531 | -1.0491 | -0.4491 |
| age_c2 | 1 | -0.6992 | 0.1451 | -0.9836 | -0.4149 |
| age_c3 | 1 | -0.5708 | 0.1475 | -0.8600 | -0.2817 |
| radio_therapy0 | 1 | -0.4188 | 0.1142 | -0.6426 | -0.1950 |
| ts_c1 | 1 | -2.4443 | 1.0533 | -4.5087 | -0.3800 |
| ts_c2 | 1 | -1.5076 | 1.0465 | -3.5587 | 0.5435 |
| ts_c3 | 1 | -1.2065 | 0.3225 | -1.8386 | -0.5744 |
| ts_c4 | 1 | -0.8475 | 0.3034 | -1.4421 | -0.2529 |
| ts_c5 | 1 | -0.6481 | 0.3454 | -1.3250 | 0.0287 |
| her_status0 | 1 | -0.7174 | 0.1357 | -0.9834 | -0.4514 |
| Niezależne prawdopodobieństwo a priori rozkładu normalnego dla współczynników regresji | ||
|---|---|---|
| Parametr | Średnia | Dokładność |
| lnep_c0 | -1.0067 | 9.90099 |
| lnep_c1 | -0.7248 | 10.06036 |
| lnep_c2 | 0 | 1E-6 |
| lnep_c3 | 0 | 1E-6 |
| age_c1 | -0.7489 | 41.15226 |
| age_c2 | -0.7001 | 46.08295 |
| age_c3 | -0.5743 | 45.24887 |
| radio_therapy0 | -0.4186 | 74.07407 |
| ts_c1 | -2.9431 | 0.629683 |
| ts_c2 | 0 | 1E-6 |
| ts_c3 | -1.1738 | 8.992806 |
| ts_c4 | -0.8098 | 10.08065 |
| ts_c5 | 0 | 1E-6 |
| her_status0 | -0.7122 | 54.94505 |
| Początkowe wartości łańcucha | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Łańcuch | Ziarno | lnep_c0 | lnep_c1 | lnep_c2 | lnep_c3 | age_c1 | age_c2 | age_c3 | radio_therapy0 | ts_c1 | ts_c2 | ts_c3 | ts_c4 | ts_c5 | her_status0 |
| 1 | 123 | -1.0181 | -0.7362 | -0.2893 | 0.1706 | -0.7490 | -0.6997 | -0.5726 | -0.4187 | -2.6494 | -1.5076 | -1.1907 | -0.8293 | -0.6481 | -0.7148 |
| Statystyki dopasowania | |
|---|---|
| DIC (im mniejsze tym lepsze) | 4491.788 |
| pD (efektywna liczba parametrów) | 9.569 |
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Analiza bayesowska
| Podsumowania i przedziały a posteriori | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| Parametr | N | Średnia | Odchylenie standardowe |
Przedział HPD 95% | |
| lnep_c0 | 10000 | -1.0135 | 0.1867 | -1.3697 | -0.6409 |
| lnep_c1 | 10000 | -0.7346 | 0.1862 | -1.0847 | -0.3557 |
| lnep_c2 | 10000 | -0.2819 | 0.2133 | -0.7132 | 0.1202 |
| lnep_c3 | 10000 | 0.1778 | 0.2335 | -0.2734 | 0.6380 |
| age_c1 | 10000 | -0.7492 | 0.1028 | -0.9493 | -0.5498 |
| age_c2 | 10000 | -0.6998 | 0.0978 | -0.8878 | -0.5044 |
| age_c3 | 10000 | -0.5746 | 0.1008 | -0.7661 | -0.3750 |
| radio_therapy0 | 10000 | -0.4191 | 0.0810 | -0.5834 | -0.2658 |
| ts_c1 | 10000 | -2.8035 | 0.8424 | -4.4936 | -1.2334 |
| ts_c2 | 10000 | -2.0194 | 1.2248 | -4.5068 | 0.0953 |
| ts_c3 | 10000 | -1.1868 | 0.1967 | -1.5693 | -0.8088 |
| ts_c4 | 10000 | -0.8235 | 0.1858 | -1.1744 | -0.4428 |
| ts_c5 | 10000 | -0.6437 | 0.2666 | -1.1688 | -0.1217 |
| her_status0 | 10000 | -0.7142 | 0.0952 | -0.8956 | -0.5292 |
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| Autokorelacje a posteriori | ||||
|---|---|---|---|---|
| Parametr | Opóźnienie 1 | Opóźnienie 5 | Opóźnienie 10 | Opóźnienie 50 |
| lnep_c0 | 0.2519 | 0.0036 | 0.0110 | -0.0122 |
| lnep_c1 | 0.2503 | -0.0096 | 0.0090 | -0.0204 |
| lnep_c2 | 0.2281 | -0.0175 | 0.0156 | -0.0101 |
| lnep_c3 | 0.1826 | -0.0017 | 0.0162 | -0.0017 |
| age_c1 | -0.0218 | 0.0126 | 0.0195 | 0.0047 |
| age_c2 | 0.0129 | -0.0113 | -0.0118 | -0.0136 |
| age_c3 | 0.0009 | 0.0129 | -0.0032 | 0.0141 |
| radio_therapy0 | -0.0174 | 0.0114 | 0.0100 | -0.0062 |
| ts_c1 | -0.0132 | -0.0172 | 0.0166 | 0.0019 |
| ts_c2 | -0.0088 | 0.0193 | 0.0138 | 0.0115 |
| ts_c3 | 0.1547 | 0.0103 | 0.0185 | 0.0007 |
| ts_c4 | 0.1692 | 0.0007 | 0.0045 | -0.0048 |
| ts_c5 | 0.1009 | -0.0076 | -0.0056 | -0.0208 |
| her_status0 | 0.0301 | 0.0001 | 0.0027 | 0.0131 |
| Diagnostyka Geweke | ||
|---|---|---|
| Parametr | z | Pr. > |z| |
| lnep_c0 | 0.1692 | 0.8657 |
| lnep_c1 | 0.4508 | 0.6521 |
| lnep_c2 | 1.2970 | 0.1946 |
| lnep_c3 | -0.0268 | 0.9786 |
| age_c1 | -0.3329 | 0.7392 |
| age_c2 | -0.3959 | 0.6922 |
| age_c3 | -0.0877 | 0.9301 |
| radio_therapy0 | 0.4067 | 0.6842 |
| ts_c1 | 0.5312 | 0.5952 |
| ts_c2 | 0.7959 | 0.4261 |
| ts_c3 | 0.7521 | 0.4520 |
| ts_c4 | 1.0582 | 0.2900 |
| ts_c5 | -0.0979 | 0.9220 |
| her_status0 | 1.1254 | 0.2604 |
| Efektywne liczebności prób | |||
|---|---|---|---|
| Parametr | ESS | Czas autokorelacji |
Skuteczność |
| lnep_c0 | 5944.0 | 1.6824 | 0.5944 |
| lnep_c1 | 5790.6 | 1.7270 | 0.5791 |
| lnep_c2 | 6211.5 | 1.6099 | 0.6212 |
| lnep_c3 | 6875.1 | 1.4545 | 0.6875 |
| age_c1 | 11083.4 | 0.9023 | 1.1083 |
| age_c2 | 9748.9 | 1.0258 | 0.9749 |
| age_c3 | 10000.0 | 1.0000 | 1.0000 |
| radio_therapy0 | 10666.9 | 0.9375 | 1.0667 |
| ts_c1 | 10270.5 | 0.9737 | 1.0271 |
| ts_c2 | 10000.0 | 1.0000 | 1.0000 |
| ts_c3 | 7406.4 | 1.3502 | 0.7406 |
| ts_c4 | 7229.0 | 1.3833 | 0.7229 |
| ts_c5 | 8321.3 | 1.2017 | 0.8321 |
| her_status0 | 9432.7 | 1.0601 | 0.9433 |
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